Choć Linux ma opinię systemu o silnych zabezpieczeniach, dzięki której jest często wybierany w przypadku serwerów firmowych, tak naprawdę żaden system operacyjny nie jest całkowicie zabezpieczony przed atakiem z użyciem złośliwego oprogramowania. Złośliwe oprogramowanie jest tak skonstruowane, że przyczyną naruszenia zabezpieczeń często jest błąd człowieka — podanie swoich danych, używanie słabych haseł czy niezainstalowanie dostępnych aktualizacji.
Jedną z zalet Linuksa jest to, że aktualizacje zabezpieczeń są nie tylko regularnie udostępniane, ale też ogólnie mają opinię bardzo skutecznych, dzięki czemu użytkownicy korzystają z najlepszych dostępnych zabezpieczeń systemu operacyjnego.
Inną zaletą jest to, że Linux automatycznie przypisuje uprawnienia ograniczonego dostępu — jeśli haker uzyska dostęp do jego konta użytkownika, jest mniejsza szansa, że przejmie zabezpieczone dane lub uprawnienia administratora.
Systemy operacyjne Windows i Mac są używane częściej niż Linux, ale osoby o niecnych zamiarach wiedzą, że zyskuje on coraz większą popularność wśród użytkowników serwerów firmowych. Włamując się do systemu Linux, hakerzy prawdopodobnie spróbują się dostać do serwera, a nie pojedynczego punktu końcowego. Z tego względu firmy nie powinny być zbyt pewne siebie — aby zmniejszyć ryzyko ataku, konieczne jest używanie oprogramowania antywirusowego.